In den ersten fünf Jahren sterben die meisten Mauersegler. Die durchschnittliche Lebenserwartung liegt bei 4,3 bis 6,2 Jahren.
Die jährliche Mortalität bei adulten Mauerseglern liegt bei ca. 20%. Die Sterblichkeitsrate bei Einjährigen ist dagegen geringer, da sie nicht an den Brutort gebunden sind und somit an Wetterfluchten teilnehmen können. Die jährliche Mortalität für Mauersegler im ersten Lebensjahr liegt bei 29%.
Bedrohungen für Mauersegler sind Steinmarder, Wiesel und Hauskatzen und natürlich der Mensch, da er die Brutplätze gefährdet.